More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0573 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  100 
 
 		 421 aa  883    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  47.22 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.47 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 334 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.22 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  23.62 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.63 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.56 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.56 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.11 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.56 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  25.88 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  28.69 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  26.27 
 
 		 324 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  27.17 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  22.82 
 
 		 354 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  25.27 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  22.16 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  25.07 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.91 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  22.65 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  24.89 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  24.37 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.87 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  23.84 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  23.61 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  22.45 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  31.35 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  22.45 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  23.61 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  22.45 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  23.98 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.4 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.86 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  23.45 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.38 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  23.3 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.2 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.93 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  20.11 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.61 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.33 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  24.79 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.44 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  23.33 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2712  luciferase family protein  25.45 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.688075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  22.04 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  23.75 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  26.16 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.41 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  23.44 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  24.35 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  24.39 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.95 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.34 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.11 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  24.01 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  22.65 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.34 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  22.48 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  27.71 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  28.98 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  25.36 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  21.1 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.99 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.46 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  34.5 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  24.4 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  23.58 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.18 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  24.26 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  30.56 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  22.8 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  23.08 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.51 
 
 		 354 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  23.16 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  23.96 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  22.97 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  26.16 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.09 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  23.96 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.78 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>