More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5609 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  62.42 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  62.37 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  66.2 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  65.85 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  62.78 
 
 		 268 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  57.97 
 
 		 300 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  57.81 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  57.14 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  57.14 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  53.99 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.83 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.36 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  38.3 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  38.72 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  38.49 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  37.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  39.2 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  44.44 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  42.97 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  40.52 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.15 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.32 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  41.3 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  39.84 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  35.97 
 
 		 995 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.46 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.82 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  38.1 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  46.67 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  45.56 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  45.56 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  39.53 
 
 		 446 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  36.96 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  46.81 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  36.52 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  44.09 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 590 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  42.27 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  46.24 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  44.83 
 
 		 430 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  44.09 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  30.87 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  40.71 
 
 		 727 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  37.31 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  35.97 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  39.45 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.6 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  40.71 
 
 		 727 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  36.07 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  41 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  43.33 
 
 		 751 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  43.48 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  40.86 
 
 		 486 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  45.74 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  39.52 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  43.01 
 
 		 669 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  45.56 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.3 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.3 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  38.46 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  44.32 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  32.57 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  43.96 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  44.32 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  44.32 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  35.77 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.14 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  35.4 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.54 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  44.68 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  34.38 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  34.09 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  42 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  42.72 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  43.48 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  40.91 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  35.48 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  38.71 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  40.91 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  37.17 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  40.86 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0266  peptidase M23B  30.41 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  43.62 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  40 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  42.55 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  34.86 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  38.05 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  38.05 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  36.09 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3418  peptidase M23B  30.41 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  40.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  43.62 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  33.14 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>