More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5458 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  75.54 
 
 		 234 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  74.36 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 234 aa  321  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  71.18 
 
 		 227 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  46.12 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  45.26 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  46.15 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  45.3 
 
 		 239 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  45.3 
 
 		 239 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  45.26 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  44.87 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  44.87 
 
 		 291 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  43.58 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.88 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.48 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  37.26 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  35.32 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  35.32 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.01 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.18 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.53 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  38.76 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  36.4 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  35.96 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.19 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.38 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  31.19 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.3 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  32.04 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.13 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.3 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  29.02 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  31.63 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.02 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.73 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  29.77 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  32.27 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.09 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.24 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.88 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.97 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.13 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  28.57 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  28.26 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.13 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.46 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.46 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  27.43 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.55 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>