More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1280 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 		 703 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 731 aa  1516    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  60.84 
 
 		 712 aa  844    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  46.91 
 
 		 710 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  46.76 
 
 		 711 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  45.02 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  43.85 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 704 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.23 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 675 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  38.83 
 
 		 696 aa  479  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 687 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.69 
 
 		 774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.69 
 
 		 774 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.69 
 
 		 774 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 774 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 774 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 708 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.2 
 
 		 784 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 782 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  30.64 
 
 		 774 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.9 
 
 		 784 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  31.12 
 
 		 782 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 774 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 777 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 693 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.14 
 
 		 784 aa  273  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  30.07 
 
 		 731 aa  259  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  28.19 
 
 		 717 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 720 aa  248  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 723 aa  240  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 721 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 721 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  28.33 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 807 aa  229  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 809 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 782 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.64 
 
 		 705 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 700 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 727 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 729 aa  127  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 727 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 821 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 751 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.86 
 
 		 737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 675 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 		 518 aa  112  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 664 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 665 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 708 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 656 aa  94.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 698 aa  94  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 711 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 698 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 698 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 708 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 702 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.22 
 
 		 709 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.24 
 
 		 706 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 705 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 653 aa  91.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  23.2 
 
 		 656 aa  90.9  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 700 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 710 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 653 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.13 
 
 		 706 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 700 aa  90.5  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.11 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.87 
 
 		 711 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.46 
 
 		 706 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.97 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.5 
 
 		 700 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.5 
 
 		 700 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.46 
 
 		 721 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 713 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.6 
 
 		 664 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 736 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  23.46 
 
 		 846 aa  87  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  23.45 
 
 		 626 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 706 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  22.58 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 702 aa  84  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.61 
 
 		 695 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.68 
 
 		 653 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.3 
 
 		 696 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>