117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0416 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0416  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  51.13 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.96 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  34.48 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 		 445 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  42.59 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  35.96 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  28.09 
 
 		 436 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  33 
 
 		 487 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.76 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  38.54 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  39.73 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  39.58 
 
 		 410 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  34.62 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  30.5 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  44.68 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  44.68 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  44.68 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  41.51 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  34.34 
 
 		 419 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.14 
 
 		 458 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  42.55 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  30.87 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  44.44 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  34.25 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  30.48 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  46.81 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  30.77 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  37.04 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  35.85 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  36.99 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  26.12 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  22.73 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 		 455 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  40.43 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  43.75 
 
 		 684 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  34.69 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  48.57 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  35.85 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  37.8 
 
 		 546 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  36.96 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  28.43 
 
 		 423 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  43.4 
 
 		 424 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  35.42 
 
 		 828 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  46.94 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  38.03 
 
 		 399 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  28.49 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  36.17 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  43.48 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  28.43 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  42 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  35.85 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  37.88 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  36.96 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  43.75 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  35.56 
 
 		 450 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  34.12 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  36 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  42.22 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  40.43 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  38.24 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  40 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  34.04 
 
 		 641 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  36.92 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  34.78 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  36.08 
 
 		 530 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  27.4 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  42.55 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 		 497 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  22.22 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  43.18 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.9 
 
 		 564 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  39.22 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  38.78 
 
 		 469 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  28.7 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  36 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.43 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  40.38 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  45.83 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 415 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>