More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0126 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  73.26 
 
 		 205 aa  280  9e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  72.49 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  71.66 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  51.31 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  47.4 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.41 
 
 		 901 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  42.77 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  37.56 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.79 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  37.5 
 
 		 234 aa  114  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  38.07 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.93 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40.31 
 
 		 688 aa  111  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.54 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  34.33 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37.36 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  39.49 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  43.11 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  36.04 
 
 		 703 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  38.58 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 705 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  34.01 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  35.03 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  35.9 
 
 		 207 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  35.83 
 
 		 254 aa  104  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.99 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  35.68 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  38.27 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  37.75 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  39.73 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  38.78 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 210 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.19 
 
 		 233 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.65 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  36.28 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  36.36 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  35.12 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  42.24 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.78 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.05 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.5 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  34.87 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  36.22 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  38.78 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  34.33 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 211 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  34.21 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.16 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  34.57 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 243 aa  98.2  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  37.95 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  38.62 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  33.99 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.21 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  37.57 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  32.51 
 
 		 219 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  41.62 
 
 		 662 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 213 aa  96.3  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  38.24 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  39.18 
 
 		 686 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 224 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>