More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2235 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  67.55 
 
 		 1027 aa  1454    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.01 
 
 		 1019 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1027 aa  727    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 		 1019 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1015 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  38 
 
 		 1025 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1018 aa  730    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  51.9 
 
 		 1029 aa  1006    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1022 aa  2077    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.82 
 
 		 1010 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 		 1012 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.39 
 
 		 1016 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1056 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1036 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1019 aa  567  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1013 aa  569  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  32.85 
 
 		 1036 aa  562  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1019 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1021 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  32.52 
 
 		 1019 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.3 
 
 		 1032 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1021 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  32 
 
 		 1025 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1017 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.72 
 
 		 1039 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1040 aa  545  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1020 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1039 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1039 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1036 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1057 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1048 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1047 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1013 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1047 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  32.16 
 
 		 1015 aa  532  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1024 aa  532  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.65 
 
 		 1028 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.1 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.2 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1029 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1040 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1036 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1019 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1027 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  31.74 
 
 		 1015 aa  529  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1048 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1024 aa  526  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1029 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1031 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.2 
 
 		 1033 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1016 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1029 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  32.07 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1049 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1042 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1028 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1049 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.17 
 
 		 1014 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1021 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1033 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1018 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1050 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1029 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.81 
 
 		 1017 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1024 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  31.57 
 
 		 1015 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1046 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1053 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1028 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1035 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1029 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1017 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1054 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1035 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1017 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1047 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1014 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1029 aa  516  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1035 aa  515  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1025 aa  516  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1029 aa  515  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1027 aa  516  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1009 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1048 aa  512  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1047 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1047 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1059 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1067 aa  512  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 		 1053 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1020 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1021 aa  513  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.2 
 
 		 1046 aa  512  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  31 
 
 		 1027 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1023 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  32.25 
 
 		 1017 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.39 
 
 		 1025 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1018 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1017 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>