More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00322 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  76.46 
 
 		 1026 aa  1279    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  100 
 
 		 823 aa  1673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.52 
 
 		 1026 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  38.6 
 
 		 1015 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 		 1027 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  37.84 
 
 		 1025 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 		 1015 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1025 aa  545  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.41 
 
 		 1019 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1030 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.38 
 
 		 1020 aa  532  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  37 
 
 		 1040 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  37.86 
 
 		 1018 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  38.53 
 
 		 1015 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  38.41 
 
 		 1015 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  38.41 
 
 		 1015 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  38.41 
 
 		 1015 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  37.62 
 
 		 1018 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1021 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 		 1018 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1044 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1017 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1050 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1023 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1044 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1053 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1034 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1024 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1011 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1046 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1043 aa  300  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1027 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1040 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1044 aa  291  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1038 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1048 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1043 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1034 aa  274  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1050 aa  272  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1058 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1028 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1156 aa  264  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1039 aa  263  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1173 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1059 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1026 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1067 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.1 
 
 		 1063 aa  260  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1071 aa  260  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.67 
 
 		 1024 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1028 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1095 aa  258  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1041 aa  258  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1028 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1055 aa  257  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1038 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1034 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1062 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1204  multidrug efflux system subunit MdtC  26.1 
 
 		 1029 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.357144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1041 aa  254  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1054 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1054 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1054 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1470 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1032 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.76 
 
 		 1081 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  25.91 
 
 		 1030 aa  250  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.2 
 
 		 1024 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  25.3 
 
 		 1026 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1027 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1065 aa  249  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 		 1039 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1085 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1027 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1083 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1083 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.03 
 
 		 1040 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1085 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1085 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1018 aa  247  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1085 aa  247  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1087 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1087 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1087 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 		 1051 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  22 
 
 		 1058 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.63 
 
 		 1034 aa  245  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1087 aa  245  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1028 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1030 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1014 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1082 aa  244  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1051 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1086 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1029 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1028 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  29.42 
 
 		 1166 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 1496 aa  241  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.72 
 
 		 1091 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.89 
 
 		 1036 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>