More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3327 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  100 
 
 		 391 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  83.51 
 
 		 391 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  66.93 
 
 		 386 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  64.78 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  48.59 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  47.42 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  50.78 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  47.52 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  41.62 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  40.45 
 
 		 395 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  36.27 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  36.1 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  36.6 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  34.5 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  34.29 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  34.29 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  34.29 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  31.95 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.17 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  34.84 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  32.91 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  32.9 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  33.07 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  33.76 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  33.76 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  33.76 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  33.93 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  32.73 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  30.63 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  30.69 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  32.56 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  31.61 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  32.32 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  32.32 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  31.35 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  31.35 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  31.01 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  31.01 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  31.01 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  31.81 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  26.77 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  30.89 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.97 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.23 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.24 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  26.68 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  28.72 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.97 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  28.28 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.22 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.37 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  27.37 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.41 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.18 
 
 		 615 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  26.3 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 983 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  29.25 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 984 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 806 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 825 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 804 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.44 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>