161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53294 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53294  Hypothetical WD-40 repeat protein  100 
 
 
1117 aa  2288    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149122  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10017  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11870)  27.3 
 
 
1010 aa  130  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324509  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00190  conserved hypothetical protein  21.39 
 
 
1280 aa  128  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.619242  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42930  predicted protein  24.65 
 
 
661 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.816964  normal  0.204876 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51367  predicted protein  24.65 
 
 
661 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149439  normal  0.0143416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 
1163 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.29 
 
 
1831 aa  67.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.82 
 
 
742 aa  67  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.83 
 
 
1868 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.84 
 
 
696 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.97 
 
 
1652 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00081  G-protein beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74214]  30.52 
 
 
352 aa  65.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  18.62 
 
 
919 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  23.65 
 
 
452 aa  62  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 
1208 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  21.76 
 
 
389 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  24.6 
 
 
654 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  23.91 
 
 
473 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.28 
 
 
930 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0818  WD-40 repeat-containing protein  31.72 
 
 
834 aa  58.9  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.15 
 
 
1901 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  25.64 
 
 
928 aa  58.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.26 
 
 
1236 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.34 
 
 
947 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  25.19 
 
 
618 aa  58.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  19.03 
 
 
1484 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03830  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 
343 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.39 
 
 
898 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  18.64 
 
 
675 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  18.62 
 
 
1454 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.74 
 
 
682 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.3 
 
 
1188 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  21.65 
 
 
1280 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  26.09 
 
 
264 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.98 
 
 
1211 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.84 
 
 
1443 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.73 
 
 
1247 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  20.26 
 
 
438 aa  56.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  20.99 
 
 
1190 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1363 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  21.67 
 
 
1357 aa  55.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  19.05 
 
 
1523 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  19.23 
 
 
1474 aa  55.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.57 
 
 
774 aa  55.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  26.02 
 
 
444 aa  55.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  20.6 
 
 
1193 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  31.82 
 
 
678 aa  54.7  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 
589 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.62 
 
 
596 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.26 
 
 
443 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
316 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.7 
 
 
792 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  20.57 
 
 
1364 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  23.14 
 
 
1416 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  32 
 
 
757 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
1196 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  25.13 
 
 
935 aa  53.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  26.77 
 
 
511 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 
728 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  19.17 
 
 
1856 aa  52.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  21.77 
 
 
1399 aa  52.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3307  predicted protein  25.2 
 
 
373 aa  52.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272794  normal  0.166953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.32 
 
 
842 aa  52.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.48 
 
 
676 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  23.02 
 
 
407 aa  52.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1354  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 
519 aa  52.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1213 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.77 
 
 
1760 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.55 
 
 
608 aa  52  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  30 
 
 
656 aa  51.6  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.75 
 
 
576 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  25.68 
 
 
922 aa  51.6  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  19.09 
 
 
1041 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.76 
 
 
1242 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30256  beta transducin  26.11 
 
 
977 aa  51.6  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 
1878 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  28.66 
 
 
435 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3644  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1740 aa  51.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511908  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.83 
 
 
316 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  22.79 
 
 
522 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04800  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06910)  24.22 
 
 
660 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
772 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  28.15 
 
 
342 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.88 
 
 
1686 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  22.5 
 
 
589 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.05 
 
 
630 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
772 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  20.47 
 
 
1012 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  24.7 
 
 
813 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 
1411 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.87 
 
 
1097 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  18.98 
 
 
1262 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.75 
 
 
434 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.9 
 
 
1823 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.74 
 
 
1209 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  23.31 
 
 
778 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  19.79 
 
 
1221 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.73 
 
 
1214 aa  49.3  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02050  sulfur metabolite repression control protein, putative  24.29 
 
 
861 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  35.19 
 
 
612 aa  48.9  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>