More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00190 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00190  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1280 aa  2618    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.619242  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10017  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11870)  39.38 
 
 
1010 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324509  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53294  Hypothetical WD-40 repeat protein  22.12 
 
 
1117 aa  151  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149122  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42930  predicted protein  32.76 
 
 
661 aa  124  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.816964  normal  0.204876 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51367  predicted protein  32.76 
 
 
661 aa  124  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149439  normal  0.0143416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.16 
 
 
1868 aa  107  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.83 
 
 
1221 aa  97.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.56 
 
 
1357 aa  92.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  30.43 
 
 
389 aa  91.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.52 
 
 
696 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.37 
 
 
589 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.09 
 
 
930 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.34 
 
 
947 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  29.33 
 
 
324 aa  90.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.48 
 
 
1652 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 
1163 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.97 
 
 
676 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
1190 aa  87.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 
443 aa  86.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.28 
 
 
1188 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.91 
 
 
1523 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.16 
 
 
682 aa  84  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 
1363 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.84 
 
 
630 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.56 
 
 
1196 aa  82.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.33 
 
 
1240 aa  82  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.89 
 
 
1236 aa  82  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  29.03 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  31.73 
 
 
742 aa  81.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
1831 aa  81.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 
1411 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.76 
 
 
716 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.21 
 
 
1557 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 
1193 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 
1474 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.3 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 
1443 aa  79  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.94 
 
 
677 aa  79  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.44 
 
 
574 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 
520 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05910  hypothetical protein  26.32 
 
 
949 aa  76.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 
520 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 
1686 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1247 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 
1213 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.77 
 
 
692 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.5 
 
 
657 aa  76.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 
608 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.51 
 
 
1039 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.18 
 
 
919 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.94 
 
 
865 aa  76.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.11 
 
 
1364 aa  75.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.9 
 
 
1481 aa  75.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.87 
 
 
1041 aa  75.5  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.76 
 
 
898 aa  75.5  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.83 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.48 
 
 
664 aa  75.1  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.93 
 
 
564 aa  74.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.02 
 
 
740 aa  74.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.91 
 
 
1807 aa  74.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  30.37 
 
 
540 aa  74.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.56 
 
 
1208 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
577 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 
418 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 
317 aa  73.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 
1553 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.03 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.98 
 
 
828 aa  72.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 
1609 aa  72  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 
840 aa  72  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.05 
 
 
1344 aa  72  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  27.93 
 
 
578 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.48 
 
 
698 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  27.76 
 
 
522 aa  71.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 
464 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.36 
 
 
1626 aa  70.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.51 
 
 
1510 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  30.64 
 
 
534 aa  70.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 
589 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.01 
 
 
1416 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.84 
 
 
790 aa  70.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.88 
 
 
1856 aa  70.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.77 
 
 
596 aa  70.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.88 
 
 
1211 aa  69.7  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.23 
 
 
1367 aa  70.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
1878 aa  69.3  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.52 
 
 
1598 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  27.27 
 
 
1280 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 
1607 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.11 
 
 
1242 aa  69.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.48 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.65 
 
 
1004 aa  68.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.73 
 
 
1217 aa  68.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  28.72 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1188 aa  68.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30256  beta transducin  27.71 
 
 
977 aa  67.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.14 
 
 
1267 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
687 aa  67.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  29.03 
 
 
346 aa  68.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 
1760 aa  68.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>