More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35815 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  100 
 
 		 764 aa  1577    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  42.13 
 
 		 1092 aa  598  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  43.85 
 
 		 1001 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  29.23 
 
 		 942 aa  291  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  33.33 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  124  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  26.8 
 
 		 413 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.09 
 
 		 892 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  24.62 
 
 		 484 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  22.68 
 
 		 484 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  28.28 
 
 		 482 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  25.07 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  28.33 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  28.03 
 
 		 642 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  28.87 
 
 		 497 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  24.21 
 
 		 418 aa  101  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  25.36 
 
 		 437 aa  99.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  24.91 
 
 		 443 aa  98.6  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  27.5 
 
 		 500 aa  97.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  24.15 
 
 		 422 aa  96.3  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  27.87 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  25.97 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  24.22 
 
 		 423 aa  96.3  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  26.84 
 
 		 454 aa  93.6  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  25.62 
 
 		 1015 aa  93.2  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  26.14 
 
 		 481 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  23.01 
 
 		 422 aa  91.7  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  25.43 
 
 		 514 aa  91.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  30.04 
 
 		 467 aa  91.3  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  25.75 
 
 		 497 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  40.59 
 
 		 114 aa  88.2  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  24.93 
 
 		 405 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  25.84 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  23.6 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  27.51 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  24.47 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  31.52 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 770 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46.34 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  46.34 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  46.34 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1672  DNA ligase, NAD-dependent  45.68 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.672303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1997  DNA ligase, NAD-dependent  52.11 
 
 		 703 aa  68.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  31.09 
 
 		 993 aa  68.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46.34 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  31.52 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1398  putative DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase [NAD+]) protein  43.82 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  45.98 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 691 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2083  DNA ligase, NAD-dependent  45.57 
 
 		 731 aa  67  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0521924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  38.46 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.77 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  40.62 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  45 
 
 		 693 aa  65.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  48 
 
 		 683 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.53 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.95 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  43.9 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.53 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.528438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.22 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  43.01 
 
 		 683 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1272  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 817 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.229595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  43.24 
 
 		 687 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  23.37 
 
 		 894 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  38.05 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  44.87 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  43.04 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 690 aa  63.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  43.75 
 
 		 723 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  40.78 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1526  DNA ligase, NAD-dependent  38.37 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0626416  normal  0.309916 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10917  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 		 1127 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.31 
 
 		 659 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  36.14 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  33.08 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  35.9 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.56 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  24.43 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  37.17 
 
 		 716 aa  62  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 707 aa  62  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 705 aa  62  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.95 
 
 		 717 aa  62  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.12 
 
 		 706 aa  62  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  40.91 
 
 		 684 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  24.07 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  36.97 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.33 
 
 		 679 aa  62  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  26.26 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2505  DNA ligase, NAD-dependent  45.21 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.68 
 
 		 776 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0011  DNA ligase, NAD-dependent  33.05 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>