127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29213 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  62.74 
 
 		 668 aa  862    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  82.03 
 
 		 679 aa  1107    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  100 
 
 		 668 aa  1343    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  43.48 
 
 		 692 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  42.11 
 
 		 680 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  37.44 
 
 		 724 aa  412  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  34.34 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  35.3 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  31.82 
 
 		 674 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  29.85 
 
 		 709 aa  316  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  30.7 
 
 		 704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  29.74 
 
 		 659 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  31.76 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  31.77 
 
 		 658 aa  297  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  22.73 
 
 		 500 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  23.62 
 
 		 554 aa  87  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  23.21 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  21.84 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  21.05 
 
 		 474 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  22.27 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  21.41 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  20.33 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.73 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.4 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 		 527 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  23.89 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 		 593 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.6 
 
 		 472 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.47 
 
 		 556 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.89 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.35 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.89 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.05 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  22.74 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  21.96 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 490 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  21.69 
 
 		 539 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.97 
 
 		 461 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  24.62 
 
 		 577 aa  54.3  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 476 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  23.47 
 
 		 575 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.06 
 
 		 530 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24 
 
 		 522 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.36 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.84 
 
 		 500 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.21 
 
 		 482 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.08 
 
 		 592 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  27.33 
 
 		 482 aa  51.6  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.53 
 
 		 639 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  23.71 
 
 		 504 aa  51.2  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.94 
 
 		 506 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 587 aa  51.2  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.66 
 
 		 483 aa  51.2  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.95 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  22.81 
 
 		 583 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  21.06 
 
 		 565 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  23.42 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  24.51 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  24.08 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.41 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  21.1 
 
 		 479 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 510 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  20.73 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  21.25 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  25.33 
 
 		 499 aa  47.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  31.63 
 
 		 529 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.21 
 
 		 495 aa  47.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.44 
 
 		 524 aa  47.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.85 
 
 		 561 aa  47.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  29.02 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  24.5 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  21.86 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.38 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.24 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  21.27 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.74 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.38 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.41 
 
 		 506 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  21.92 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  21.53 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 511 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.25 
 
 		 493 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  21.28 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  20.36 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.44 
 
 		 487 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.39 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  28.21 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.02 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  20.92 
 
 		 562 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.92 
 
 		 492 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>