More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44844 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44844  predicted protein  100 
 
 		 424 aa  876    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02735  hypothetical protein  32.54 
 
 		 283 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.469687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.02 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.98 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  33.5 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27160  predicted protein  38.86 
 
 		 213 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0714983 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29749  predicted protein  38.86 
 
 		 213 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0571734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  32.68 
 
 		 341 aa  96.7  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  32.08 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.71 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.39 
 
 		 296 aa  94.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2822  RluA family pseudouridine synthase  33.64 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000591979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.49 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  34.62 
 
 		 322 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  34.69 
 
 		 305 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2620  RluA family pseudouridine synthase  29.08 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  33.17 
 
 		 348 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  33.79 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  35.78 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  30.05 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.28 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  30.58 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  30.58 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  32.86 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  30.58 
 
 		 329 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  33.49 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  29.11 
 
 		 318 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  31.68 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  29.86 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.18 
 
 		 296 aa  90.1  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0018  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  33.16 
 
 		 326 aa  89.7  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  29.71 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  32.27 
 
 		 319 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  33.48 
 
 		 313 aa  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  30.1 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2911  pseudouridine synthase  32.57 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  30.66 
 
 		 226 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  31.75 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  28.85 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  31.19 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3611  RluA family pseudouridine synthase  29.14 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354938  hitchhiker  0.00827113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2521  pseudouridine synthase  33.98 
 
 		 240 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  30.85 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  34.27 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.64 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15960  predicted protein  34.69 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  31.07 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  32.43 
 
 		 362 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  34.27 
 
 		 352 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  31.85 
 
 		 306 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  32.34 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  32.85 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  33.8 
 
 		 352 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  30.43 
 
 		 320 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  32.2 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  28.19 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.2 
 
 		 458 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  32.83 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  32.32 
 
 		 342 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  27.65 
 
 		 306 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 303 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1442  pseudouridine synthase  32.11 
 
 		 287 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3480  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.34 
 
 		 348 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0583016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1472  pseudouridine synthase  32.11 
 
 		 287 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  31.5 
 
 		 339 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1436  pseudouridine synthase  32.11 
 
 		 287 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  32.64 
 
 		 309 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  30.5 
 
 		 331 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.46 
 
 		 321 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  32.33 
 
 		 501 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0886  pseudouridine synthase  36.1 
 
 		 579 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  31.19 
 
 		 324 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  31.09 
 
 		 314 aa  86.3  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  32.66 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.69 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.03 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002742  tRNA pseudouridine synthase C  28.44 
 
 		 256 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.766432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  31.11 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.15 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.66 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.48 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.67 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  30.99 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  30.43 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  32.34 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  33.17 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12586  predicted protein  34.16 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  31.84 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.12 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.784854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.86 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  31.96 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1575  pseudouridine synthase, RluD  30.39 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.75 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  31.92 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2717  tRNA pseudouridine synthase C  31.36 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0912  pseudouridine synthase, RluA family  30.77 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00634483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1262  pseudouridylate synthase  31.22 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.308846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.04 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  31.84 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  32.83 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>