226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43552 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43552  predicted protein  100 
 
 		 971 aa  2017    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43052  predicted protein  38.23 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  28.51 
 
 		 464 aa  167  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.73 
 
 		 703 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  27.41 
 
 		 698 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  25.36 
 
 		 653 aa  124  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14403  phospholipase  27.36 
 
 		 359 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990038  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1764  predicted protein  27.55 
 
 		 389 aa  112  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289242  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  24.33 
 
 		 427 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2316  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  26.05 
 
 		 357 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  23.06 
 
 		 521 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 		 680 aa  95.1  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  24.3 
 
 		 527 aa  88.2  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 682 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 705 aa  84.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  23.37 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  23.4 
 
 		 424 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 		 418 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.06 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  22.87 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  38.76 
 
 		 422 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 		 417 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 434 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 389 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  24.8 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  26.12 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  25.8 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  28.09 
 
 		 835 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  24.19 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  23.4 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 788 aa  71.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  23.4 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 547 aa  70.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  23.29 
 
 		 427 aa  70.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  26.79 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  38.74 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  26.79 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  26.79 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  26.42 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.39 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  26.42 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  31.61 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  24.53 
 
 		 1247 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.99 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  36 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  28.11 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  28.48 
 
 		 517 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  22.73 
 
 		 535 aa  63.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.09 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  21.58 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  23.52 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 829 aa  62.4  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  27.03 
 
 		 874 aa  62.4  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  23.38 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 		 553 aa  62  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 417 aa  62  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 420 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 434 aa  62  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  31.07 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 832 aa  61.6  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  24.33 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  28.68 
 
 		 571 aa  60.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  25.51 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  21.07 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  20.94 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>