More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0740 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  43.96 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  29.51 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  33.77 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.11 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  35.94 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  34.35 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  35.66 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  27.81 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  30.16 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.2 
 
 		 450 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 532 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  35.97 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  35.38 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.13 
 
 		 384 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  32.08 
 
 		 365 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  32.47 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 365 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  30.16 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 448 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  25.52 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  29.34 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  32.54 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.58 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  31.09 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  30.11 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  30.47 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  31.43 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  31.25 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  29.14 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  36.63 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  27.85 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  31.75 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  29.73 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  28.82 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  35.64 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.88 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  29.73 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  32.33 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  32.54 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  29.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  31.71 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  29.1 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  31.3 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  29.6 
 
 		 582 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  31.3 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  31.3 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  31.3 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  26.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  32.23 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  30.37 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  26.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  26.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  26.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  28.15 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  30.43 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  30.43 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>