83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2400 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  98.49 
 
 		 661 aa  1328    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  100 
 
 		 661 aa  1348    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  65.41 
 
 		 668 aa  834    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  59.76 
 
 		 660 aa  742    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  57.01 
 
 		 662 aa  732    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  33.28 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  33.93 
 
 		 664 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  32.34 
 
 		 671 aa  297  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  30.06 
 
 		 666 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  31.27 
 
 		 676 aa  257  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  27.62 
 
 		 673 aa  238  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  27.47 
 
 		 677 aa  231  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  27.72 
 
 		 660 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  25 
 
 		 660 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  24.02 
 
 		 663 aa  170  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  23.97 
 
 		 671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  24.3 
 
 		 672 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  34.62 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  24.44 
 
 		 683 aa  134  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  22.66 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  22.79 
 
 		 690 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  36 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  37.5 
 
 		 354 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  22.3 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  33.02 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.5 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  32.26 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  30.95 
 
 		 657 aa  54.7  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  35.44 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  44.23 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  35.53 
 
 		 1018 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.19 
 
 		 1018 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  44.23 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  36.67 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.77 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  44.23 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  34.33 
 
 		 1047 aa  50.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  34.21 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  22.89 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.01 
 
 		 1038 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.4 
 
 		 906 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.46 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  25.45 
 
 		 1020 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  42.59 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  32.63 
 
 		 1022 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.89 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25.09 
 
 		 859 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 804 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  34.62 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.69 
 
 		 1020 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  26.05 
 
 		 693 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  26.05 
 
 		 693 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  28.85 
 
 		 1081 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  35.62 
 
 		 986 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  39.62 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 1029 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  38.6 
 
 		 986 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  34.57 
 
 		 995 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  22.53 
 
 		 895 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  28.1 
 
 		 1031 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  36.84 
 
 		 962 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.89 
 
 		 1020 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1346 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  23.49 
 
 		 1017 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  40 
 
 		 890 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  40 
 
 		 1009 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.81 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  30.43 
 
 		 953 aa  44.7  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  32.98 
 
 		 987 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  37.74 
 
 		 1029 aa  44.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.09 
 
 		 859 aa  44.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.73 
 
 		 859 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  34.21 
 
 		 1046 aa  44.3  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.53 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  35.09 
 
 		 1046 aa  44.3  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.9 
 
 		 904 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  24.56 
 
 		 1165 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.53 
 
 		 1029 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>