192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0437 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  100 
 
 
405 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
393 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.02 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.71 
 
 
200 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.71 
 
 
200 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
211 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.42 
 
 
218 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
208 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.89 
 
 
199 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
703 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
197 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  30.68 
 
 
233 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1418 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1255 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
209 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.38 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
206 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0435  regulatory protein, Crp  33.33 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0427117  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11461  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.9 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.9 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
243 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  31.43 
 
 
243 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.92 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
210 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.28 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.36 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.78 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
211 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
223 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.15 
 
 
229 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.06 
 
 
223 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
221 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
179 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
247 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02711  global nitrogen regulatory protein  31.84 
 
 
244 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
232 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.67 
 
 
227 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
236 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.63 
 
 
250 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
235 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
254 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.51 
 
 
214 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 
251 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
225 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
236 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
238 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
232 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.21 
 
 
225 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 
223 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
226 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
800 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
602 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.38 
 
 
232 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.26 
 
 
226 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4941  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
45 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
903 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
217 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
228 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.49 
 
 
232 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2484  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.17 
 
 
202 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
222 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
233 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1632  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
250 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  30.53 
 
 
575 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
1021 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.01 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0369  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
198 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.91 
 
 
236 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.73 
 
 
229 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 
222 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.05 
 
 
226 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
239 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.07 
 
 
239 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.64 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.59 
 
 
745 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0436703 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.88 
 
 
243 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.63 
 
 
220 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.46 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.39 
 
 
224 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>