62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0369 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0369  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1117  putative PAS/PAC sensor protein  45.16 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1115 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 682 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1839  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.15 
 
 		 763 aa  71.6  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.338108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1298  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.58 
 
 		 777 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.765489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  34.86 
 
 		 575 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 604 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  36.11 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1431  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  26.04 
 
 		 806 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.333003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  28.39 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 602 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.14 
 
 		 619 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 1251 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.4 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0436703 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 800 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1715  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.18 
 
 		 749 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 705 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 436 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 439 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 		 354 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 		 365 aa  51.2  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 405 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2973  hypothetical protein  35.79 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2550  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.46 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 660 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  22.76 
 
 		 585 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 673 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 641 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 		 834 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 703 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 560 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.27 
 
 		 853 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 773 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 		 633 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.29 
 
 		 853 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 874 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1021 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 		 1258 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 1425 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 		 1092 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 389 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 873 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 638 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 430 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5392  sensory box/GGDEF family protein  31.4 
 
 		 909 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98335e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 545 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  23.12 
 
 		 303 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 728 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1480 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.23 
 
 		 909 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5543  sensory box/GGDEF family protein  31.4 
 
 		 909 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.129042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5151  sensory box/GGDEF family protein  31.4 
 
 		 909 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.954767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>