More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0318 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  100 
 
 		 365 aa  755    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  38.72 
 
 		 555 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  33.91 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  31.95 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  30.9 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  31.55 
 
 		 675 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  35.97 
 
 		 502 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.88 
 
 		 513 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.01 
 
 		 513 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  27.62 
 
 		 380 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.04 
 
 		 595 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.84 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.05 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.83 
 
 		 601 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.14 
 
 		 610 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  25.27 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  24.16 
 
 		 600 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2466  hypothetical protein  29.18 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  28.95 
 
 		 491 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.72 
 
 		 616 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  26.82 
 
 		 507 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2324  hypothetical protein  28.25 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.78 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  25.76 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.19 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.94 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  26.35 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  24.85 
 
 		 533 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  26.35 
 
 		 410 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  26.35 
 
 		 410 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  25.38 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  25.95 
 
 		 711 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  28.28 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  25.92 
 
 		 405 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.53 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.08 
 
 		 530 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.69 
 
 		 614 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.06 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  26.14 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.02 
 
 		 793 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.66 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  25.3 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.27 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  27.11 
 
 		 345 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.61 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.92 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1037 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.71 
 
 		 504 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.73 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  25.63 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.92 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.92 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  25.23 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.58 
 
 		 669 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.4 
 
 		 513 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  24.78 
 
 		 530 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.07 
 
 		 487 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.63 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.84 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.26 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.28 
 
 		 635 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  21.33 
 
 		 526 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.64 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  24.5 
 
 		 778 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  23.62 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  24.7 
 
 		 445 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  24.56 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  23.91 
 
 		 674 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.59 
 
 		 481 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  23.36 
 
 		 715 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  24.7 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.72 
 
 		 485 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.33 
 
 		 480 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.59 
 
 		 483 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.62 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.61 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  23.65 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.79 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  24.62 
 
 		 547 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  22.96 
 
 		 529 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.95 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.8 
 
 		 485 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  25.15 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  24.4 
 
 		 658 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  23.75 
 
 		 466 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  24.78 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.25 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.48 
 
 		 484 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.66 
 
 		 408 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  24.59 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  25.81 
 
 		 533 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.83 
 
 		 505 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.92 
 
 		 485 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.85 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.51 
 
 		 417 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.92 
 
 		 485 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>