139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0117 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  96.46 
 
 		 424 aa  840    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 424 aa  871    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  72.79 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  65.4 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  64.93 
 
 		 420 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  64.93 
 
 		 420 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  64.45 
 
 		 420 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  62.8 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  62.56 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  62.56 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  62.56 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  62.32 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  58.47 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  59.67 
 
 		 418 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  64.38 
 
 		 390 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  64.43 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  61.19 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  61.19 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  53.85 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  49.88 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  47.64 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  47.41 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  48.48 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  47.53 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  47.53 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  47.03 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  47.09 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  47.29 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  48.4 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  46.24 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  47.49 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  46.59 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  47.06 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  46.45 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  46.57 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  49.54 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  49.54 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  48.1 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  46.35 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  49.31 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  46.26 
 
 		 447 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  45.31 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  46.34 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  45.66 
 
 		 455 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  45.43 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  45.43 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  45.43 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  47.16 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  47.63 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  44.64 
 
 		 463 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  44.99 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  44.44 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  47.42 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  46.84 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  45.48 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  45.48 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  43.29 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  42.82 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  43.29 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  43.47 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  44.68 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  43.62 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  44.71 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  42.35 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  41.94 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  41.29 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  39.9 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  39.47 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.33 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  41.21 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  37.53 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  28.92 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  28.73 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  27.44 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  29.4 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  29.21 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  27.38 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  29.35 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.49 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  28 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  28.06 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  29.95 
 
 		 262 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 		 572 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.03 
 
 		 572 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  28.19 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  26.41 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  25.28 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  26.54 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  24.94 
 
 		 427 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  26.24 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  25.81 
 
 		 469 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  26.88 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  28.51 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.83 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>