More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16231 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 359 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  72.45 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  74.38 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  66.56 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  56.69 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  56.37 
 
 		 321 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  43.28 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  42.16 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  42.62 
 
 		 304 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  40.76 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  40.62 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  44.04 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  44.61 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  41.14 
 
 		 320 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  39.71 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  40.89 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.55 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.13 
 
 		 315 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.22 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.48 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  34.44 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  35.5 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 		 735 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  34.05 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.9 
 
 		 989 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  31.54 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  34.42 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  33.58 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  31.9 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.84 
 
 		 750 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.68 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  32.74 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.55 
 
 		 759 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  30.55 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 761 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.55 
 
 		 759 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  34.7 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  32 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  30.9 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  36.77 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  30.9 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  30.9 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  31.55 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  30.87 
 
 		 310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  35.43 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  36.77 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  33.82 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  33.82 
 
 		 316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  32.25 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  32.24 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  30.79 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  29.7 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.26 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  33.82 
 
 		 316 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.74 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  30.55 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  32.76 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  33.12 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  30.19 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.93 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  30.38 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  30.15 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  32.71 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  30.19 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  33.56 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.56 
 
 		 750 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  30.32 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>