68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4353 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  100 
 
 		 470 aa  954    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  60.61 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25.69 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  24.86 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  29.34 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.92 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.21 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.12 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  25.53 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.44 
 
 		 351 aa  57  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.38 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.18 
 
 		 288 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.29 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5474  hypothetical protein  25.84 
 
 		 314 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.21 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.39 
 
 		 381 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  30.67 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  23.88 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  26.58 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.2 
 
 		 251 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  23.79 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.11 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.33 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  22.88 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.55 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25.77 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.05 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  26.9 
 
 		 334 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  21.09 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  23.38 
 
 		 362 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  23.08 
 
 		 363 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.22 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.89 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  24.57 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  21.14 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  27.62 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.07 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.89 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.74 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.62 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  24.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  25.84 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  22.16 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.91 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  22.53 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.84 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  23.66 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  29.21 
 
 		 251 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  31.54 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  24.24 
 
 		 471 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  22.81 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>