More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3899 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1161    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  46.85 
 
 		 581 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  35.76 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  35.96 
 
 		 602 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  36.38 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  36.99 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.4 
 
 		 597 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  41.13 
 
 		 596 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  38.17 
 
 		 609 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.71 
 
 		 623 aa  333  6e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  37.21 
 
 		 612 aa  329  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  33.11 
 
 		 596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  32.94 
 
 		 596 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  37.25 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.44 
 
 		 622 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  36.76 
 
 		 609 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  34.54 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.12 
 
 		 592 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 		 592 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.28 
 
 		 627 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.06 
 
 		 592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  34.52 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  34.52 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  33.82 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  35.35 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  35.96 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  35.03 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  35.22 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.79 
 
 		 593 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 		 593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.62 
 
 		 592 aa  286  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  31.09 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.84 
 
 		 589 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  30.8 
 
 		 590 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  30.63 
 
 		 590 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 		 593 aa  282  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  33.06 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.31 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  34.03 
 
 		 614 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.07 
 
 		 610 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.22 
 
 		 605 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.22 
 
 		 605 aa  273  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  32.74 
 
 		 632 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.96 
 
 		 609 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  35.57 
 
 		 591 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  33.87 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.78 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.83 
 
 		 630 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  31.36 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.83 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  31.37 
 
 		 593 aa  267  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  33.77 
 
 		 604 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  32.85 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  31.03 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.67 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  31.03 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.7 
 
 		 599 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.61 
 
 		 610 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.73 
 
 		 606 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.36 
 
 		 619 aa  264  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  32.89 
 
 		 593 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.83 
 
 		 610 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  35.69 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.93 
 
 		 608 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.77 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.51 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.9 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.93 
 
 		 608 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.07 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.07 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.31 
 
 		 616 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.82 
 
 		 610 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.07 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.07 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.07 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  29.68 
 
 		 650 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.23 
 
 		 609 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.14 
 
 		 609 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.97 
 
 		 624 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.07 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  29.9 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  31.54 
 
 		 620 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  32.5 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.78 
 
 		 621 aa  257  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.73 
 
 		 599 aa  257  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  33.39 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.7 
 
 		 588 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  31.83 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  33.45 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  29.39 
 
 		 591 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  32.49 
 
 		 602 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.49 
 
 		 613 aa  253  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.23 
 
 		 594 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.97 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>