More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3509 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
436 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  43.95 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  43.15 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  39.21 
 
 
451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  41.63 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
469 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 
439 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 
428 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
464 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 
424 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  35.97 
 
 
432 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
427 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 
423 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.57 
 
 
435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
421 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
448 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
462 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 
436 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
458 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  33.18 
 
 
451 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
448 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
435 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
476 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
447 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  29.16 
 
 
437 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
445 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
451 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
462 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
501 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
444 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27.29 
 
 
458 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
468 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
459 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
444 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
481 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
441 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 
473 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
490 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  26.16 
 
 
450 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
444 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
446 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
452 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
460 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
463 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
487 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
462 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  22.56 
 
 
406 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
451 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  22.17 
 
 
452 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.95 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  39.07 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
350 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.37 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.56 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  22.48 
 
 
447 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
342 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.11 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25.86 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>