More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0703 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 954 aa  1921    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 879 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 871 aa  230  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 904 aa  221  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.11 
 
 		 877 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 874 aa  217  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 857 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 944 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 849 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 869 aa  204  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  24.97 
 
 		 880 aa  204  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 901 aa  201  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 842 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 873 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 875 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 987 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 904 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 904 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 935 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.6 
 
 		 834 aa  193  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 873 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 935 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 935 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 935 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 904 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 855 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 861 aa  191  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 838 aa  190  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 904 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 924 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 861 aa  189  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 855 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.21 
 
 		 853 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 884 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 861 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 910 aa  185  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 847 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1001 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 981 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 966 aa  183  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 861 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 930 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 861 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 852 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 956 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 930 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 930 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 861 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 927 aa  181  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 897 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 981 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 957 aa  180  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 872 aa  180  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 953 aa  179  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 907 aa  178  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 886 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 928 aa  178  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 886 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 841 aa  178  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 933 aa  178  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 867 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 966 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 836 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 985 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.27 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 853 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 853 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 907 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 853 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 937 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 1055 aa  174  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 867 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 867 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 843 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 867 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.9 
 
 		 827 aa  172  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 925 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 709 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 975 aa  171  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 901 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 952 aa  170  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 882 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.26 
 
 		 839 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 974 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 944 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 882 aa  168  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 890 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 890 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 890 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 1040 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 965 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1006 aa  161  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 941 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 941 aa  161  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>