More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3952 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  55.61 
 
 		 205 aa  227  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  43.12 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  46.92 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  37.3 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  30.77 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.96 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  33 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>