More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1666 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  95.72 
 
 		 421 aa  805    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 421 aa  857    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  77.38 
 
 		 421 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  41.13 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  40.96 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  38.05 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  33.33 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 444 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 469 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 470 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2948  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 445 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 444 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  27.3 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 440 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 421 aa  93.6  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  25.99 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 452 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.41 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.94 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29870  carbohydrate-binding protein  25 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.94 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.71 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.53 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.53 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.97 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>