More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18985 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  100 
 
 
638 aa  1300    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26262  predicted protein  31.15 
 
 
1148 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746999  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
906 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  33.63 
 
 
726 aa  180  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44966  predicted protein  32.43 
 
 
822 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  26.48 
 
 
574 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  27.79 
 
 
1326 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
1002 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.24 
 
 
1082 aa  150  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  28.15 
 
 
1519 aa  150  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.91 
 
 
959 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  28.6 
 
 
1142 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 
1152 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
1108 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
1089 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  29.93 
 
 
1386 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.87 
 
 
1125 aa  144  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  28.46 
 
 
1120 aa  143  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.16 
 
 
1362 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1112 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.06 
 
 
1120 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  27.47 
 
 
1087 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  27.55 
 
 
956 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.5 
 
 
1437 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  27.13 
 
 
1558 aa  138  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  27.64 
 
 
1381 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  27.42 
 
 
872 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  25 
 
 
1111 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  28.27 
 
 
1354 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  26.96 
 
 
1904 aa  137  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
1082 aa  137  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  28.6 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.6 
 
 
1134 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.81 
 
 
1164 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
1449 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  29.27 
 
 
1181 aa  135  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
1403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26634  predicted protein  40.84 
 
 
233 aa  134  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  26.79 
 
 
914 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  26.01 
 
 
1222 aa  133  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  27.22 
 
 
1431 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  25.84 
 
 
1407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.08 
 
 
918 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  26.42 
 
 
1259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  27.37 
 
 
896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  26.75 
 
 
1023 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  26.09 
 
 
1250 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  28.42 
 
 
1154 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  27.33 
 
 
995 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.64 
 
 
1110 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  28.75 
 
 
991 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.84 
 
 
1025 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.45 
 
 
918 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  27.53 
 
 
773 aa  130  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  26.16 
 
 
1193 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  26.71 
 
 
1414 aa  130  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  28.03 
 
 
872 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.71 
 
 
1194 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  26.65 
 
 
1070 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  27.5 
 
 
1284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
1357 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  27.91 
 
 
1084 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  27.62 
 
 
1082 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  27.84 
 
 
1080 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
1068 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  27.04 
 
 
1062 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  26.72 
 
 
1068 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.25 
 
 
918 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  28.13 
 
 
1159 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  27.29 
 
 
886 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  26.51 
 
 
1082 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
1105 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  26.51 
 
 
1082 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
1105 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  29.13 
 
 
1127 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
1068 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  30.84 
 
 
1006 aa  126  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.25 
 
 
1102 aa  126  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  26.25 
 
 
1517 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  28.1 
 
 
918 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  27.61 
 
 
970 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 
1139 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
918 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  27.67 
 
 
1130 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  28.26 
 
 
1064 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  29.57 
 
 
1394 aa  125  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
1021 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.02 
 
 
1091 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  28.39 
 
 
1033 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
617 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  25.98 
 
 
1069 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  27.47 
 
 
1084 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  27.8 
 
 
918 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  27.8 
 
 
918 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  28.26 
 
 
1064 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  28.26 
 
 
1064 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  28.26 
 
 
1064 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  28.26 
 
 
1064 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
1104 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
1261 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>