More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0653 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  100 
 
 		 531 aa  1075    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  74.86 
 
 		 533 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  60.04 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  55.34 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  51.85 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  51.4 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  54.75 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  53.02 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  53.02 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  53.02 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  48.66 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  47.76 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  46.36 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  49.59 
 
 		 566 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  45.74 
 
 		 530 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  40.94 
 
 		 544 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  40.24 
 
 		 519 aa  329  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  42.56 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  40.04 
 
 		 519 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  36.18 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  33.62 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  31.96 
 
 		 803 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.6 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.78 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.36 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  30.85 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.68 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.87 
 
 		 544 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.61 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.19 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.92 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.87 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  33.73 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  32.07 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.78 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.51 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.06 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.5 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  31.37 
 
 		 547 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.06 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.5 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.5 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.51 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.5 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.28 
 
 		 485 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.78 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.11 
 
 		 526 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.06 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.84 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.31 
 
 		 517 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  29.24 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  29.24 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.48 
 
 		 620 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  30.48 
 
 		 655 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  28.6 
 
 		 603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.45 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.51 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  27.01 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  25.45 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  27.16 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.11 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.33 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 481 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 481 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.36 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  30.22 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.01 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.04 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.93 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.64 
 
 		 822 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.34 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.77 
 
 		 551 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.68 
 
 		 601 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  27.07 
 
 		 384 aa  103  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.39 
 
 		 399 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.81 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.14 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.18 
 
 		 834 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.18 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.25 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  25.99 
 
 		 717 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.92 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.29 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.28 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  25.34 
 
 		 395 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.96 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  28.03 
 
 		 391 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.37 
 
 		 669 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  25.4 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.14 
 
 		 595 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.73 
 
 		 430 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.05 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.7 
 
 		 480 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.78 
 
 		 501 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  23.75 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.37 
 
 		 486 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.43 
 
 		 658 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>