271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4192 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4192  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  31.58 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  32.12 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  32.12 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.16 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.99 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.96 
 
 		 425 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  31.46 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  32.95 
 
 		 435 aa  102  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  29.47 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  29.47 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  33.79 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0907  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.086185  normal  0.263875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2124  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  30.72 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  29.41 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  31.46 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  29.54 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  28.08 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 447 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.85 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  27.15 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>