145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3152 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 260 aa  510  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  73.66 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  71.19 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  70.37 
 
 		 246 aa  324  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  66.53 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  71.49 
 
 		 260 aa  318  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  73.25 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  71.67 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  60.98 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  66.81 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  56.77 
 
 		 232 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  51.43 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  54.73 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  50.42 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  50.66 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  50.66 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  47.84 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  47.95 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  48.37 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  47.83 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  45.42 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  44.78 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  43.67 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  39.43 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  39.43 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  33.47 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  32.48 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  33.47 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  32.27 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  31.95 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  34.02 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  33.33 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  32.78 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  34.02 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  31.45 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  34.19 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.05 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  31.76 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.19 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  30.7 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  30.34 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.87 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.19 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.65 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  25.75 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  27.07 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  30.3 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  28.69 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.52 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  29.26 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  29.73 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.71 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.71 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  27.15 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  29.89 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  27.07 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  27.9 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  26.84 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.14 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  35.24 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  26.52 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  22.71 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.69 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  26.92 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.78 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  27.98 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  28.02 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  24.45 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  28.09 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  26.92 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  26.92 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  28.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  31.08 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  26.92 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  35.11 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  28.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  35.05 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  28.8 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>