More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2802 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  65.25 
 
 		 544 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  64.16 
 
 		 545 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  63.29 
 
 		 538 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  62.4 
 
 		 542 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  62.38 
 
 		 527 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  64.35 
 
 		 569 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  62.14 
 
 		 541 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 521 aa  1051    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  61.91 
 
 		 540 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  66.67 
 
 		 556 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  64.16 
 
 		 545 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  64.89 
 
 		 540 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  60.55 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  59.3 
 
 		 528 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  59.45 
 
 		 535 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  55.85 
 
 		 544 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  54.37 
 
 		 523 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  44.36 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  43.68 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  45.17 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  43.68 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  43.11 
 
 		 563 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  43.55 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  43.57 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  44.06 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  43.07 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  43.3 
 
 		 542 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  42.52 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  44.71 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  42.52 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  45.14 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  42.34 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  44.08 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  40.95 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  45.54 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  40.55 
 
 		 539 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  41.3 
 
 		 529 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  40.04 
 
 		 529 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  41.97 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  39.46 
 
 		 533 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  40.77 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  41.15 
 
 		 520 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  42 
 
 		 528 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  40.12 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  43.43 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  43.43 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  42.11 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  39.93 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  40.15 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  42.34 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  42.95 
 
 		 536 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  39.54 
 
 		 634 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  45.89 
 
 		 526 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  40 
 
 		 528 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  41.17 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.92 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  42.68 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  41.33 
 
 		 530 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  39.58 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  39.69 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  40.5 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  45.14 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  45.14 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  38.29 
 
 		 531 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  38.29 
 
 		 531 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  41.62 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  39.35 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  39.58 
 
 		 526 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  39.92 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  42.09 
 
 		 529 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  39.77 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  39.34 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  39.88 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  42.31 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  41.43 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  41.57 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  41.51 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  42.05 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  41.43 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  38.67 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  44.92 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  41.46 
 
 		 524 aa  369  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  39.46 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  42.25 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  39.77 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  44.16 
 
 		 539 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 541 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  38.95 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  38.95 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  43.48 
 
 		 539 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  41.39 
 
 		 541 aa  362  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  39.01 
 
 		 527 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  43.8 
 
 		 539 aa  362  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  39.54 
 
 		 528 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>