More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2222 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  100 
 
 		 559 aa  1141    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  48.65 
 
 		 523 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  45.72 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  33.71 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 508 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  34.01 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  32.7 
 
 		 692 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 456 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 437 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  33.25 
 
 		 448 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  32.73 
 
 		 442 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  33.19 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  30.7 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  32.66 
 
 		 431 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  31.48 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 472 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  30.96 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.76 
 
 		 412 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.68 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 466 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.11 
 
 		 445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  29.03 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  28.11 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 458 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  28.23 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 465 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.59 
 
 		 454 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.49 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  28.36 
 
 		 639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  27.37 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 513 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  29.83 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 491 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  30.7 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  28.86 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  28.07 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  27.47 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  28.44 
 
 		 418 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 404 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  29.07 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.83 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  28.96 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  29.33 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.03 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  30.67 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  29.33 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  29 
 
 		 454 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  28.94 
 
 		 467 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  27.51 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 387 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  30.47 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  29 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.17 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  30.52 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  29 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.17 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  28.17 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  28.88 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  27.14 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  29.04 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 442 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  27.79 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  28.61 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  27.55 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 459 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>