More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2449 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 644 aa  1332    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  44.97 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  42.51 
 
 		 642 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  42.72 
 
 		 654 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  37.6 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 657 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  37.7 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  38.59 
 
 		 655 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 655 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  38.08 
 
 		 650 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  37.54 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  37.54 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  37.48 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  37.26 
 
 		 651 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  36.88 
 
 		 650 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  36.16 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 650 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 		 653 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 652 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 655 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 		 650 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 657 aa  359  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 693 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 653 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  38.5 
 
 		 678 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  36.28 
 
 		 660 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 657 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 659 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 663 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  35.18 
 
 		 707 aa  333  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  36.18 
 
 		 676 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 		 690 aa  303  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 660 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  30.39 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 		 643 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  31.86 
 
 		 643 aa  241  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.09 
 
 		 663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 661 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  30.9 
 
 		 642 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  30.9 
 
 		 642 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  27.91 
 
 		 739 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 642 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.72 
 
 		 686 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.26 
 
 		 637 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 		 641 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.28 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  30.28 
 
 		 649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  27.3 
 
 		 735 aa  216  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.68 
 
 		 642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  29.8 
 
 		 642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  28.41 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  29.5 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.69 
 
 		 669 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  28.64 
 
 		 647 aa  211  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.33 
 
 		 649 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  28.12 
 
 		 593 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  27.48 
 
 		 593 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  27.72 
 
 		 661 aa  197  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 641 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 		 641 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  29.95 
 
 		 641 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 		 641 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.54 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 641 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  28.15 
 
 		 639 aa  190  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  26.17 
 
 		 648 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 639 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.9 
 
 		 645 aa  185  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  26.8 
 
 		 643 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  26.75 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.07 
 
 		 644 aa  180  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  27.42 
 
 		 642 aa  174  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  27.49 
 
 		 640 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  28.69 
 
 		 661 aa  173  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  26.21 
 
 		 648 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  27.48 
 
 		 643 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  26.48 
 
 		 642 aa  171  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  27.77 
 
 		 650 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  26.36 
 
 		 645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  27.27 
 
 		 644 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  25.91 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  26.36 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  26.36 
 
 		 645 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>