More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4607 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  100 
 
 		 476 aa  958    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  50.32 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  29.12 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.83 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.28 
 
 		 515 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  33.13 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.72 
 
 		 547 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.68 
 
 		 613 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.12 
 
 		 546 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.5 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.06 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 		 517 aa  106  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  30.04 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.42 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.55 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 504 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.57 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.41 
 
 		 509 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 537 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.64 
 
 		 521 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.89 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.89 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  28.05 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.27 
 
 		 506 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.63 
 
 		 534 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 510 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.63 
 
 		 537 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.63 
 
 		 534 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  29.37 
 
 		 534 aa  96.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.11 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.05 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.89 
 
 		 484 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.74 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.18 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.86 
 
 		 558 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.96 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.58 
 
 		 665 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  30.08 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.27 
 
 		 563 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.15 
 
 		 551 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 		 576 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.85 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.85 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  31.83 
 
 		 562 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.23 
 
 		 552 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.15 
 
 		 522 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 415 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.85 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.39 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.51 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.85 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.14 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  29.2 
 
 		 500 aa  87.4  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  23.34 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 565 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.56 
 
 		 547 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.48 
 
 		 578 aa  87  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.48 
 
 		 601 aa  87  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  26.24 
 
 		 518 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.66 
 
 		 482 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.54 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.8 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  27.45 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.11 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  20.93 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.64 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.65 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.87 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.16 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  21.23 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  22.38 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.61 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.94 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.5 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.87 
 
 		 597 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.12 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.98 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.19 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  31.21 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.62 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  26.99 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.17 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.12 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  29.04 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.23 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.2 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.23 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.89 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.09 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.21 
 
 		 738 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>