More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1165 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1165  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 357 aa  729    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  30.96 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  28.72 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1560 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 815 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 353 aa  85.9  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 1093 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1714 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 570 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.4 
 
 		 744 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 3706 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.81 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  29.33 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 613 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 732 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  25.12 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 2693 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 941 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 834 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.95 
 
 		 1663 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1676 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 871 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.57 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 749 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 874 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 616 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 526 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 747 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 878 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.95 
 
 		 1668 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  29.74 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.22 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 709 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>