More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3473 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  100 
 
 		 238 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  68.22 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  69.77 
 
 		 225 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  72.9 
 
 		 228 aa  288  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  69.48 
 
 		 227 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  60.47 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  62.62 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  59.63 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  56 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  54.46 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  54.95 
 
 		 305 aa  228  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  55.22 
 
 		 357 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  54.63 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  56.31 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.63 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  55.11 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.33 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.67 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.37 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  52.49 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  55.81 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  45.68 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.87 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.22 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.63 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.64 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  46.8 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.2 
 
 		 263 aa  177  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  43.04 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  44.65 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.6 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.6 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  43.36 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.1 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.02 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  40.97 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  53.4 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  43.04 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.82 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  44.98 
 
 		 288 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  43.48 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  36.94 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.04 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.43 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  44.39 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  50.48 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  45.79 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  42.86 
 
 		 266 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 264 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  40.85 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.12 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  37.39 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  41.63 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  42.38 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.38 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.17 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.53 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.86 
 
 		 252 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  40.09 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  42.65 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1414  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  47.09 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.63 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  44.81 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.13 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  45.54 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  47.53 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.9 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.23 
 
 		 455 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  45.74 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  45.74 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  41.92 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.73 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>