More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0675 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  100 
 
 
829 aa  1700    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  42.2 
 
 
861 aa  621  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  43.84 
 
 
858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  38.71 
 
 
850 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.71 
 
 
888 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  35.49 
 
 
877 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  36.08 
 
 
878 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.88 
 
 
883 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  34.35 
 
 
885 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.93 
 
 
870 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  35.15 
 
 
877 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  37.53 
 
 
855 aa  462  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  36.09 
 
 
872 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  34.32 
 
 
866 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  31.97 
 
 
875 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.74 
 
 
866 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  33.22 
 
 
888 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.63 
 
 
866 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  32.63 
 
 
879 aa  434  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  32.89 
 
 
896 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.2 
 
 
876 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.2 
 
 
876 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  33.22 
 
 
896 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  33.17 
 
 
846 aa  426  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  32.93 
 
 
885 aa  422  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  31.49 
 
 
884 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  34.88 
 
 
880 aa  415  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  31 
 
 
912 aa  412  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  33.44 
 
 
903 aa  412  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  32.92 
 
 
890 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  31.37 
 
 
901 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  32.27 
 
 
845 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  32.93 
 
 
894 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  33.67 
 
 
893 aa  405  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  35.36 
 
 
861 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  33.26 
 
 
862 aa  402  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  33.14 
 
 
879 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  31.63 
 
 
905 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  31.45 
 
 
910 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  31.86 
 
 
877 aa  398  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  32.75 
 
 
836 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  30.63 
 
 
931 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  29.46 
 
 
872 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  30.51 
 
 
929 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 
901 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  29.54 
 
 
908 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  46.32 
 
 
944 aa  350  7e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  42.72 
 
 
1043 aa  350  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  43.06 
 
 
1013 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  42.82 
 
 
1024 aa  347  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  41.88 
 
 
979 aa  346  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  41.09 
 
 
943 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  30.18 
 
 
889 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  41.18 
 
 
928 aa  340  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  42.12 
 
 
1016 aa  340  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  41.41 
 
 
978 aa  339  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  41.41 
 
 
979 aa  339  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  42.59 
 
 
1021 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  40.94 
 
 
976 aa  337  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  31.59 
 
 
895 aa  336  1e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  36.84 
 
 
1004 aa  334  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  40.63 
 
 
1032 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  43.39 
 
 
928 aa  334  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  41.13 
 
 
935 aa  332  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  41.18 
 
 
1047 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  42.35 
 
 
924 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  41.41 
 
 
1060 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  41.18 
 
 
1047 aa  330  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  41.18 
 
 
1047 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  41.88 
 
 
968 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  40.85 
 
 
978 aa  328  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  42.58 
 
 
992 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  42.34 
 
 
915 aa  326  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  40.9 
 
 
940 aa  326  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  45.72 
 
 
930 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  40.19 
 
 
932 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  39.73 
 
 
1033 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.46 
 
 
903 aa  323  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  38.85 
 
 
904 aa  323  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  40.19 
 
 
1020 aa  323  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  40.94 
 
 
1000 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  42.93 
 
 
928 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  42.44 
 
 
926 aa  321  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  41.46 
 
 
1025 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.39 
 
 
915 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  40.94 
 
 
973 aa  320  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  40.71 
 
 
1014 aa  320  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  41.4 
 
 
934 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.22 
 
 
891 aa  319  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  41.71 
 
 
931 aa  317  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  40.43 
 
 
938 aa  317  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.61 
 
 
939 aa  317  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  41.04 
 
 
934 aa  316  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.15 
 
 
915 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  39.6 
 
 
999 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  40.24 
 
 
1010 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.43 
 
 
931 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  39.15 
 
 
1016 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  41.65 
 
 
939 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  39.46 
 
 
937 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>