More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5938 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  45.36 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  44.34 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  41.08 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  36.88 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  37.62 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  34.53 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  34.53 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  34.53 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  34.87 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  38.79 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  36.49 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  37.17 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  34.94 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  37.19 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.73 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  35.81 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  33.44 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  36.55 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  36.55 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  36.55 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  36.55 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  33.77 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  33.77 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  33.33 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  38.12 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  29.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  34.93 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  38.16 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  41.86 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  31.09 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  29.55 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.6 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  32 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  28.48 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  32 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  32 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.72 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  25.64 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.75 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.24 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  24.05 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  32.05 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  26.67 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  28.47 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.5 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  22.92 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  28.69 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.15 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.34 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  28.76 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  36.59 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.71 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  26.05 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.05 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  29.56 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  27.14 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.57 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  23.69 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  29.54 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>