232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2566 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  60 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.59 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.64 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  61.8 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  61.58 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  64.44 
 
 		 409 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  58.99 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  51.65 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  46.67 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  45.05 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  45.78 
 
 		 225 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  44.57 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.56 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.13 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  51.37 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.71 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.31 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  44 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.43 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.44 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.89 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.63 
 
 		 172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  39.44 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.22 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  41.14 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.72 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.18 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.11 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  39.16 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  39.16 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.29 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  38.42 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.24 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  38.38 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.66 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  37.57 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  40.59 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.46 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.43 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  34.66 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  36.14 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.54 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.86 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.14 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.54 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.93 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.34 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.69 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.14 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.69 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  31.93 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  31.61 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.08 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.08 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.75 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  36.13 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.77 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  30.91 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  32.48 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  27.68 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  29.76 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  31.85 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  28.82 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.9 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.53 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  32.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.9 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.21 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  32.74 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  27.11 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.9 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  32.9 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.9 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.61 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.06 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.61 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.36 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.11 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>