286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0107 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  68.33 
 
 		 181 aa  247  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  47.37 
 
 		 182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  46.78 
 
 		 182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  46.78 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  43.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  43.27 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  39.47 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  42.11 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  43.29 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  39.08 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  42.02 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  42.69 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  45.57 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  38.82 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  39.2 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  37.21 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  46.51 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  35.43 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  34.88 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  35.09 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  41.52 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  35.59 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  35.82 
 
 		 205 aa  114  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  36.32 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  33.16 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  40.35 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  43.02 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  30.41 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.98 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  30.65 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  35.22 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  30.87 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  31.45 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  30.46 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  29.75 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  30.64 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  31.25 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  29.31 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  28.19 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  28.19 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  30 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  32.53 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  32.7 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  27.59 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  39.18 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  26.44 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  31.13 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  27.22 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  30.06 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  30.26 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  27.22 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  29.75 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  25.32 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  27.22 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  28.86 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  28.93 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  30.19 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  29.53 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  25.86 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  25.86 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  30.19 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  27.78 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  30.19 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  31.06 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  28.19 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  31.06 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  30.52 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  27.17 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  29.53 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  25.29 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  26.03 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  30.32 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  32.47 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  28.49 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  25.14 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  28.66 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  25.86 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>