More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1245 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  53.27 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  38.91 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  39.37 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  39.37 
 
 		 263 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  36.11 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  36.44 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  36.65 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  37.93 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>