More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4734 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.14 
 
 		 984 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  71.99 
 
 		 796 aa  1102    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.48 
 
 		 991 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 798 aa  1607    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  92.8 
 
 		 792 aa  1429    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  92.61 
 
 		 803 aa  1437    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 		 977 aa  479  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 		 970 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.8 
 
 		 858 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 917 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  44.03 
 
 		 998 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 1022 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 927 aa  416  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 791 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 		 1003 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  39.44 
 
 		 910 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 975 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 974 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1002 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1765 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 816 aa  337  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 687 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1763 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1767 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1768 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 1271 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1767 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1767 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1771 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 823 aa  319  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1267 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 755 aa  314  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1236 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 1765 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 1046 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 933 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  32.05 
 
 		 1188 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1236 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1234 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.48 
 
 		 1236 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1236 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1236 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 689 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 1782 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1784 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1238 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1238 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1238 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1230 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1786 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1238 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1245 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  30.09 
 
 		 1200 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1792 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 1002 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.15 
 
 		 2035 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.63 
 
 		 1361 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1303 aa  283  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1362 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1234 aa  281  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1064 aa  281  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  35.94 
 
 		 1125 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1125 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.37 
 
 		 1233 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 865 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.44 
 
 		 1331 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1202 aa  275  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 		 1245 aa  274  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.69 
 
 		 2213 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 1124 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1266 aa  272  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 916 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1009 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1177 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1172 aa  271  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1340 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.14 
 
 		 1135 aa  270  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1350 aa  270  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1303 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1548 aa  270  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.94 
 
 		 923 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 984 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1070 aa  269  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 2654 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1582 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 919 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 989 aa  267  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 1166 aa  267  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1352 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 647 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 1626 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1362 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1165 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1193 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1193 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1917 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1363 aa  265  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1788 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 989 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 647 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>