114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1875 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 		 179 aa  357  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  45.16 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  48.55 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  45.81 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  47.1 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  48.48 
 
 		 136 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  42.04 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  46.56 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  46.56 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  40.94 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  40.6 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  37.27 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  41.67 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  40.6 
 
 		 165 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  40.65 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  37.06 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  35.51 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  35.07 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  36.43 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  39.72 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  39.72 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  39.72 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  39.01 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  35.56 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  40.88 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  40.15 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  32.24 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  37.4 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  31.88 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  35.21 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  37.96 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  35.21 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  34.81 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  37.58 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  37.58 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  31.69 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  35.8 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  36.94 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  36.48 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  37.09 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  37.09 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  33.33 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  35.19 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.59 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  35.19 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  36.42 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  35.37 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  35.22 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  35.22 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  34.51 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  34.51 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  34.59 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  31.69 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  31.82 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  29.63 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  35.03 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  40.77 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  31.65 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  35.76 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  34.84 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  33.33 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  31.88 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.8 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  35.93 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  29.52 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  36.59 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  34.19 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  35.62 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  30.43 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  30.43 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  33.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  32.79 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  42.86 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  34.02 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  34.02 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  34.78 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>