More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2129 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 858 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.73 
 
 		 857 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  45.94 
 
 		 879 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.89 
 
 		 846 aa  898    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 871 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  45.94 
 
 		 879 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 838 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 838 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  45.94 
 
 		 885 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 848 aa  897    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1645  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70.23 
 
 		 810 aa  1158    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  45 
 
 		 846 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 857 aa  851    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 842 aa  708    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.7 
 
 		 862 aa  898    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  45 
 
 		 835 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.77 
 
 		 873 aa  929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 838 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 841 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 862 aa  1761    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 		 870 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 841 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 848 aa  898    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.27 
 
 		 856 aa  893    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 838 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  45.94 
 
 		 885 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 838 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 838 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 838 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 838 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 		 848 aa  840    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.664527  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.68 
 
 		 857 aa  862    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  45 
 
 		 835 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  45 
 
 		 835 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 845 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 799 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 		 902 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 662 aa  218  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 680 aa  217  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 716 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 716 aa  190  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 848 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 683 aa  184  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 630 aa  183  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 707 aa  177  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 727 aa  177  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 975 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 710 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 608 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 708 aa  171  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 698 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 461 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 963 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 471 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 513 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 514 aa  165  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  35.59 
 
 		 811 aa  164  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 501 aa  164  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  25.77 
 
 		 737 aa  162  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 473 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 510 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 494 aa  160  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 527 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  36.86 
 
 		 406 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 503 aa  159  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 515 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 526 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 398 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 509 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 510 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 845 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  38.98 
 
 		 355 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 511 aa  155  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 355 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4653  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.93 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3682  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 685 aa  154  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00804168  normal  0.462115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  40 
 
 		 630 aa  154  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 524 aa  154  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 513 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 659 aa  154  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 512 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.11 
 
 		 1845 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 636 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 748 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1000 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 773 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 501 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 634 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 515 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 457 aa  151  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  35.77 
 
 		 758 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 902 aa  150  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 553 aa  150  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 534 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>