More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1983 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 927 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  43.01 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.33 
 
 		 560 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  40.43 
 
 		 1694 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.94 
 
 		 730 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 1276 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  37.11 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.67 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 543 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 4079 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  35.79 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  42.39 
 
 		 955 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 		 810 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.11 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  41.18 
 
 		 1007 aa  68.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 740 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 878 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 836 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.65 
 
 		 707 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 512 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 562 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 4489 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 576 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1121 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 1276 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 3560 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 3172 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  38.1 
 
 		 715 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 632 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  39.53 
 
 		 561 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  42.7 
 
 		 1013 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.08 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  39.53 
 
 		 561 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 1737 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  36.9 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  36.73 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 3035 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1138 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0008  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  39.08 
 
 		 573 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 361 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 935 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 465 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.8 
 
 		 1022 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  32.03 
 
 		 745 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  35.35 
 
 		 267 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 363 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 317 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  34.04 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 598 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1192 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 716 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 1069 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  38.2 
 
 		 417 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 1827 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  34.07 
 
 		 1067 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 1094 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.34 
 
 		 988 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 732 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  34.94 
 
 		 564 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 922 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 761 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 909 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 713 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 		 1056 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.12 
 
 		 818 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 617 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 275 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 265 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 711 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 739 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>