115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4376 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  100 
 
 
429 aa  887    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  63.84 
 
 
449 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  63.83 
 
 
424 aa  545  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  42.38 
 
 
411 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  42.65 
 
 
418 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  34.91 
 
 
418 aa  216  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  34.55 
 
 
380 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  33.67 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  31.92 
 
 
391 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  32.66 
 
 
419 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  32.66 
 
 
419 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  32.41 
 
 
419 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  33.9 
 
 
419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 
444 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  30.9 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  32.15 
 
 
435 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.64 
 
 
419 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.03 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  30.15 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  31.14 
 
 
432 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  29.71 
 
 
430 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.64 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  28.83 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  29.78 
 
 
433 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.74 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  31.73 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  28.96 
 
 
426 aa  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  29.25 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  34.62 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  30.9 
 
 
434 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.3 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  25.47 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.25 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.01 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.62 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  29.67 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.22 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.42 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.33 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.21 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  23.74 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.65 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.09 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  28.53 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  30.75 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  28.57 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25.57 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  27.2 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  25.91 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  27.22 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  28.11 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.45 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  24.46 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.86 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  25.46 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  25.58 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  27.33 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.31 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.47 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.29 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  35.04 
 
 
120 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  25.13 
 
 
425 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  27.94 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 
430 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  25.52 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.17 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  28.93 
 
 
387 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  23.68 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  23.71 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  25.13 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  29.57 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  23.39 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.41 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  27.67 
 
 
430 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.13 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  23.43 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.89 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  34.65 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  23.21 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.15 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  27.86 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.89 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  24.44 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.81 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>