More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0370 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  100 
 
 
403 aa  805    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  37.7 
 
 
445 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  35.57 
 
 
447 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  35.76 
 
 
466 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  35.59 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  35.95 
 
 
363 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  33.23 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  33.81 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  32.85 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  32.85 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  31.34 
 
 
385 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  30.49 
 
 
385 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  31.21 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  29.91 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  28.69 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  29.67 
 
 
426 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.07 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.88 
 
 
513 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  31.2 
 
 
517 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.8 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.01 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.35 
 
 
547 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.54 
 
 
822 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.37 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.52 
 
 
523 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  27.53 
 
 
562 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.29 
 
 
520 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.83 
 
 
601 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.54 
 
 
567 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  23.32 
 
 
485 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.21 
 
 
485 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.67 
 
 
485 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.55 
 
 
485 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.24 
 
 
485 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.21 
 
 
485 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.21 
 
 
485 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  25.9 
 
 
506 aa  86.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.74 
 
 
485 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.67 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  24.28 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  23.08 
 
 
529 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.72 
 
 
475 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.42 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  28.91 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.17 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  28.24 
 
 
519 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.39 
 
 
526 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.66 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.8 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.46 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.48 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  25.66 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.5 
 
 
530 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.91 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  22.19 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.91 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  28.53 
 
 
519 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.3 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  27.54 
 
 
550 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  25.26 
 
 
603 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.23 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  25.94 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.46 
 
 
498 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.73 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  30.23 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  31.22 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  26.26 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.92 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.91 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.18 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  28.8 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  27.79 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25.71 
 
 
635 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  25 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.91 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.98 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.35 
 
 
1032 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  24.55 
 
 
480 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.96 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.36 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.95 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.96 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  26.26 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.31 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.67 
 
 
463 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.5 
 
 
803 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  22.61 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  22.84 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.53 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.35 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  26.96 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.44 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  24.65 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.81 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.16 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  25.55 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.39 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  26.27 
 
 
533 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>