More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
218 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
228 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 
215 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
238 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 
206 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  41.2 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 
216 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  43.07 
 
 
221 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
206 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
206 aa  138  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 
219 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  40.28 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
224 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
224 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
224 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
224 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  40.78 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.66 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.62 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.5 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.06 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 
271 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
330 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
227 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
332 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.53 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>